MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016112	GTT	2	6	51352	51357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403433
1002	NC_016112	CGT	2	6	51436	51441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016112	ATGG	2	8	51542	51549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016112	CCT	2	6	51598	51603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_016112	AATT	2	8	51693	51700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016112	ATA	2	6	51708	51713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016112	AGC	2	6	51720	51725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016112	CCAT	2	8	51794	51801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_016112	GGC	2	6	51810	51815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016112	CTG	2	6	51969	51974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016112	AGT	2	6	52079	52084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016112	G	6	6	52117	52122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016112	TGCC	2	8	52177	52184	0 %	25 %	25 %	50 %	357403434
1014	NC_016112	CCGA	2	8	52431	52438	25 %	0 %	25 %	50 %	357403434
1015	NC_016112	GGC	2	6	52494	52499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403434
1016	NC_016112	GCAG	2	8	52548	52555	25 %	0 %	50 %	25 %	357403434
1017	NC_016112	CGA	2	6	52625	52630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403434
1018	NC_016112	TCGAT	2	10	52714	52723	20 %	40 %	20 %	20 %	357403434
1019	NC_016112	GC	3	6	52727	52732	0 %	0 %	50 %	50 %	357403434
1020	NC_016112	TCA	2	6	52798	52803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403434
1021	NC_016112	CGA	2	6	52960	52965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1022	NC_016112	GAA	2	6	53003	53008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403435
1023	NC_016112	CGAT	2	8	53049	53056	25 %	25 %	25 %	25 %	357403435
1024	NC_016112	ATT	2	6	53105	53110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403435
1025	NC_016112	GAAA	2	8	53152	53159	75 %	0 %	25 %	0 %	357403435
1026	NC_016112	TGC	2	6	53230	53235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1027	NC_016112	AAG	2	6	53346	53351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403435
1028	NC_016112	A	8	8	53438	53445	100 %	0 %	0 %	0 %	357403435
1029	NC_016112	CGT	2	6	53488	53493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1030	NC_016112	TTC	2	6	53511	53516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403435
1031	NC_016112	CGA	2	6	53530	53535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1032	NC_016112	GAT	2	6	53552	53557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403435
1033	NC_016112	GCC	2	6	53571	53576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403435
1034	NC_016112	GCC	2	6	53583	53588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403435
1035	NC_016112	GAA	2	6	53624	53629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403435
1036	NC_016112	GAT	2	6	53641	53646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403435
1037	NC_016112	CGA	2	6	53743	53748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1038	NC_016112	GAC	2	6	53776	53781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1039	NC_016112	ATC	2	6	53859	53864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403435
1040	NC_016112	TTTG	2	8	53954	53961	0 %	75 %	25 %	0 %	357403435
1041	NC_016112	CGG	2	6	53968	53973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403435
1042	NC_016112	CTG	2	6	53985	53990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1043	NC_016112	ATC	2	6	54095	54100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403435
1044	NC_016112	TGA	2	6	54216	54221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403435
1045	NC_016112	ATT	2	6	54294	54299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403435
1046	NC_016112	TTC	2	6	54318	54323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403435
1047	NC_016112	TGGC	2	8	54337	54344	0 %	25 %	50 %	25 %	357403435
1048	NC_016112	TTA	2	6	54373	54378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403435
1049	NC_016112	CAATG	2	10	54389	54398	40 %	20 %	20 %	20 %	357403435
1050	NC_016112	AGC	2	6	54412	54417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403435
1051	NC_016112	T	7	7	54469	54475	0 %	100 %	0 %	0 %	357403435
1052	NC_016112	GGT	2	6	54574	54579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403435
1053	NC_016112	A	6	6	54599	54604	100 %	0 %	0 %	0 %	357403435
1054	NC_016112	ATC	2	6	54689	54694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403435
1055	NC_016112	CGGCG	2	10	54712	54721	0 %	0 %	60 %	40 %	357403435
1056	NC_016112	GAAC	2	8	54775	54782	50 %	0 %	25 %	25 %	357403435
1057	NC_016112	GGCA	2	8	54862	54869	25 %	0 %	50 %	25 %	357403435
1058	NC_016112	CAT	2	6	55100	55105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403436
1059	NC_016112	CAA	2	6	55107	55112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403436
1060	NC_016112	GCA	2	6	55160	55165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403436
1061	NC_016112	CGG	2	6	55184	55189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
1062	NC_016112	G	6	6	55307	55312	0 %	0 %	100 %	0 %	357403436
1063	NC_016112	ATT	2	6	55418	55423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403436
1064	NC_016112	CGG	2	6	55576	55581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
1065	NC_016112	ATT	2	6	55608	55613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403436
1066	NC_016112	GGC	2	6	55785	55790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
1067	NC_016112	CGA	2	6	55922	55927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403436
1068	NC_016112	A	7	7	55936	55942	100 %	0 %	0 %	0 %	357403436
1069	NC_016112	GAA	2	6	55994	55999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403436
1070	NC_016112	ATCGA	2	10	56023	56032	40 %	20 %	20 %	20 %	357403436
1071	NC_016112	TAT	2	6	56091	56096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403436
1072	NC_016112	GCG	2	6	56124	56129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
1073	NC_016112	ATG	2	6	56130	56135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403436
1074	NC_016112	TCGA	2	8	56160	56167	25 %	25 %	25 %	25 %	357403436
1075	NC_016112	CGAT	2	8	56200	56207	25 %	25 %	25 %	25 %	357403436
1076	NC_016112	CAA	2	6	56333	56338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403436
1077	NC_016112	GCG	2	6	56421	56426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403436
1078	NC_016112	TGGGT	2	10	56434	56443	0 %	40 %	60 %	0 %	357403436
1079	NC_016112	CCG	2	6	56502	56507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403436
1080	NC_016112	GTC	2	6	56643	56648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403436
1081	NC_016112	ATCGTC	2	12	56687	56698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357403437
1082	NC_016112	ATT	2	6	56721	56726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403437
1083	NC_016112	CAG	2	6	56816	56821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403437
1084	NC_016112	TGGTT	2	10	56920	56929	0 %	60 %	40 %	0 %	357403437
1085	NC_016112	A	6	6	57064	57069	100 %	0 %	0 %	0 %	357403437
1086	NC_016112	GGT	2	6	57086	57091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403437
1087	NC_016112	TGT	2	6	57141	57146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403437
1088	NC_016112	GCA	2	6	57269	57274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_016112	CCAT	2	8	57342	57349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_016112	GGC	2	6	57358	57363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016112	CATT	2	8	57431	57438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_016112	GAG	2	6	57464	57469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016112	CTG	2	6	57482	57487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_016112	TGC	2	6	57542	57547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_016112	T	6	6	57608	57613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016112	GCA	2	6	57712	57717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1097	NC_016112	CAA	2	6	57797	57802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403438
1098	NC_016112	TCAG	2	8	57813	57820	25 %	25 %	25 %	25 %	357403438
1099	NC_016112	GCATA	2	10	57832	57841	40 %	20 %	20 %	20 %	357403438
1100	NC_016112	CAG	2	6	57856	57861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1101	NC_016112	GAA	2	6	57992	57997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403438
1102	NC_016112	CGA	2	6	58081	58086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1103	NC_016112	ATCA	2	8	58103	58110	50 %	25 %	0 %	25 %	357403438
1104	NC_016112	GTCA	2	8	58112	58119	25 %	25 %	25 %	25 %	357403438
1105	NC_016112	CGATC	2	10	58279	58288	20 %	20 %	20 %	40 %	357403438
1106	NC_016112	ATT	2	6	58370	58375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403438
1107	NC_016112	TTTG	2	8	58446	58453	0 %	75 %	25 %	0 %	357403438
1108	NC_016112	CGA	2	6	58480	58485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1109	NC_016112	AGC	2	6	58497	58502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1110	NC_016112	TGGT	2	8	58539	58546	0 %	50 %	50 %	0 %	357403438
1111	NC_016112	ATT	2	6	58567	58572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403438
1112	NC_016112	CAA	2	6	58582	58587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403438
1113	NC_016112	TCG	2	6	58677	58682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1114	NC_016112	A	6	6	58724	58729	100 %	0 %	0 %	0 %	357403438
1115	NC_016112	AGGAT	2	10	58797	58806	40 %	20 %	40 %	0 %	357403438
1116	NC_016112	ACT	2	6	58809	58814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403438
1117	NC_016112	TGA	2	6	58857	58862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
1118	NC_016112	GGAATT	2	12	58876	58887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
1119	NC_016112	GCC	2	6	58921	58926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403438
1120	NC_016112	GC	3	6	58934	58939	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
1121	NC_016112	CGA	2	6	59014	59019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403438
1122	NC_016112	CGG	2	6	59076	59081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403438
1123	NC_016112	TGGG	2	8	59099	59106	0 %	25 %	75 %	0 %	357403438
1124	NC_016112	TGA	2	6	59173	59178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
1125	NC_016112	GTT	2	6	59185	59190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403438
1126	NC_016112	TGA	2	6	59232	59237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
1127	NC_016112	GTT	2	6	59317	59322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403438
1128	NC_016112	GCTG	2	8	59340	59347	0 %	25 %	50 %	25 %	357403438
1129	NC_016112	GCATTT	2	12	59359	59370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	357403438
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1131	NC_016112	TGA	2	6	59493	59498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403438
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1133	NC_016112	GC	4	8	59540	59547	0 %	0 %	50 %	50 %	357403438
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1250	NC_016112	CAAA	2	8	65197	65204	75 %	0 %	0 %	25 %	357403440
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1252	NC_016112	GTC	2	6	65289	65294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1253	NC_016112	ATC	2	6	65369	65374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403441
1254	NC_016112	ATC	2	6	65408	65413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403441
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1263	NC_016112	A	8	8	65741	65748	100 %	0 %	0 %	0 %	357403441
1264	NC_016112	A	6	6	65781	65786	100 %	0 %	0 %	0 %	357403441
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1377	NC_016112	ATT	2	6	70385	70390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403446
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1379	NC_016112	TTAC	2	8	70429	70436	25 %	50 %	0 %	25 %	357403446
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